高通量測(cè)序(High-Throughput Sequencing)又名下一代測(cè)序(Next Generation Sequencing,NGS),以能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定和一般讀長(zhǎng)較短等為標(biāo)志。
檢測(cè)過(guò)程:
1.樣本準(zhǔn)備(sample fragmentation)
2.文庫(kù)構(gòu)建(library preparation)
3.測(cè)序反應(yīng)(sequencing reaction)
4.數(shù)據(jù)分析(data analysis)[1]
本平臺(tái)提供的服務(wù):
轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
又稱(chēng)RNA-seq,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的研究對(duì)象為特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下所能轉(zhuǎn)錄出來(lái)的mRNA,通過(guò)新一代高通量測(cè)序,能夠全面快速地獲得某一物種特定組織或器官在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本序列信息。
Small RNA測(cè)序
小RNA是一類(lèi)重要的體內(nèi)調(diào)節(jié)分子,主要包括miRNA、piRNA和siRNA。小RNA測(cè)序技術(shù)采用膠分離技術(shù),收集樣品中18-30nt的RNA片段,利用高通量測(cè)序技術(shù),一次性獲得單堿基分辨率的數(shù)百萬(wàn)條小RNA序列信息,依托強(qiáng)大的生物信息分析平臺(tái),鑒定已知小RNA,并預(yù)測(cè)新的小RNA及其靶標(biāo)基因。
LncRNA測(cè)序
lncRNA(長(zhǎng)鏈非編碼RNA,long non-coding RNA,lncRNA)測(cè)序也稱(chēng)為全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,與普通的通過(guò)polyA富集方法的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序不同的是,lncRNA測(cè)序是通過(guò)rRNA去除法從而對(duì)含有polyA尾和不含有polyA尾的RNA一同富集建庫(kù)測(cè)序。
circRNA測(cè)序
環(huán)狀RNA(circRNA)是一類(lèi)特殊的非編碼RNA分子,呈封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu),不受RNA外切酶影響,表達(dá)更穩(wěn)定,不易降解。由于circRNA的閉合環(huán)狀特性,通過(guò)去除total RNA中的rRNA和線性RNA分子,可以特異地富集circRNA分子后測(cè)序,更有針對(duì)性地分析受檢樣本中特定的circRNA譜、circRNA剪接模式、組間差異和功能等。
基因組重測(cè)序
人全基因組重測(cè)序是基于人基因組參考序列對(duì)個(gè)體或群體進(jìn)行全基因組測(cè)序,并在個(gè)體或群體水平進(jìn)行生物信息分析,從而進(jìn)行個(gè)體或群體的基因組的差異性。
宏基因組測(cè)序
宏基因組學(xué)(Metagenomics)又叫微生物環(huán)境基因組學(xué)、元基因組學(xué)。它通過(guò)直接從環(huán)境樣品中提取全部微生物的DNA,構(gòu)建宏基因組文庫(kù),利用基因組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品所包含的全部微生物的遺傳組成及其群落功能。
16s/18s/ITS測(cè)序
16S/18S/ITS等擴(kuò)增子測(cè)序,也稱(chēng)微生物多樣性測(cè)序,即通過(guò)提取環(huán)境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴(kuò)增16S/18S/ITS的某一或某幾個(gè)區(qū),通過(guò)檢測(cè)目的區(qū)域的序列變異和豐度,對(duì)環(huán)境樣本物種分類(lèi)及豐度,種群結(jié)構(gòu),系統(tǒng)進(jìn)化,群落比較等方面信息進(jìn)行分析的研究方法。16S rDNA是細(xì)菌分類(lèi)學(xué)研究中最常用的“分子鐘”,真菌可以采用18S rDNA測(cè)序的方法進(jìn)行菌種鑒定。
美軒優(yōu)勢(shì)
●
極強(qiáng)地處理復(fù)雜樣本的能力
● 豐富的建庫(kù)經(jīng)驗(yàn),加入文庫(kù)均一化技術(shù)
● 最佳的測(cè)序解決方案和快速的分析平臺(tái)
● 全面和高質(zhì)量的基因解析結(jié)果
擁有多種測(cè)序平臺(tái)和強(qiáng)大的計(jì)算機(jī)資源,提供最佳的測(cè)序解決方案和快速的分析平臺(tái);
擁有專(zhuān)業(yè)的分析團(tuán)隊(duì),全面的分析內(nèi)容,提供全面和高質(zhì)量的基因組解析結(jié)果;
客戶(hù)提供
樣本,要求如下:
樣品類(lèi)型 |
樣品要求 |
血液 |
2ml(DNA)-5ml(RNA)以上新鮮或凍存的抗凝血,或從全血中提取的白細(xì)胞,推薦使用EDTA抗凝劑,不要使用肝素抗凝 |
組織 |
動(dòng)物組織500mg(RNA)-1g(DNA)以上,植物組織2g以上 |
細(xì)胞 |
1*107個(gè)以上 |
16s/18s測(cè)序 |
常規(guī)樣本2g以上沉淀,水樣10ml以上,根據(jù)微生物豐度 |
宏基因組 |
常規(guī)樣本5g以上沉淀,水樣25ml以上,根據(jù)微生物豐度 |
做DNA方面,需冰袋運(yùn)輸;做RNA方面,樣本中需加trizol,干冰運(yùn)輸。
美軒提供
1、完整詳盡的實(shí)驗(yàn)報(bào)告;
2、實(shí)驗(yàn)中所涉及的圖片、數(shù)據(jù);
3、實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析。