RNA pull-down是檢測(cè)RNA結(jié)合蛋白與其靶RNA之間相互作用的主要實(shí)驗(yàn)手段之一,主要應(yīng)用于發(fā)現(xiàn)miRNA,lncRNA或mRNA的調(diào)節(jié)靶點(diǎn),是研究miRNA或lncRNA的利器之一。
原理
RNA pull down 原理示意圖
使用體外轉(zhuǎn)錄法標(biāo)記生物素RNA探針,然后與胞漿蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合物。該復(fù)合物可與鏈霉親和素標(biāo)記的磁珠結(jié)合,從而與孵育液中的其他成分分離。復(fù)合物洗脫后,通過western blot實(shí)驗(yàn)或MS檢測(cè)與RNA相互作用的蛋白。
客戶提供
1、樣本:細(xì)胞,≥1*107;組織,≥0.5g,干冰運(yùn)輸;
2、目的基因信息(ID號(hào))
3、若研究已知靶蛋白,提供靶蛋白信息和靶蛋白的一抗。
美軒提供
1、基因合成測(cè)序報(bào)告,構(gòu)建含目的基因的質(zhì)粒、測(cè)序報(bào)告等
2、探針序列
3、Western Blot結(jié)果或質(zhì)譜圖及蛋白質(zhì)比對(duì)結(jié)果